供应链中的风险和不确定性对商业物流信息系统的运作和效能会带来很大的挑战。然而，通过采取一些策略和措施，商业物流信息系统可以应对供应链中的风险和不确定性，确保供应链的顺畅运作。
首先，商业物流信息系统应该具备实时数据采集和监控能力。这意味着系统需要能够及时获取各个环节的物流信息，包括供应商的库存情况、运输公司的运输状态、仓库的存货量等等。通过实时数据采集和监控，系统可以及时发现供应链中的异常情况，如库存不足、运输延误等，并及时采取相应的措施进行调整和处理。
其次，商业物流信息系统应该具备风险评估和预警功能。系统应该能够对供应链中的各种风险进行评估，如供应商的财务风险、运输公司的安全风险等。同时，系统还应该能够根据风险评估结果进行预警，及时提醒管理者采取相应的应对措施。例如，系统可以通过监测供应商的财务状况，提前预警供应商可能面临的破产风险，从而及时寻找备用供应商，以避免供应链中断。
此外，商业物流信息系统还应该具备供应链模拟和优化功能。系统应该能够模拟供应链中的各种情景，并根据不同的情景进行优化。例如，系统可以通过模拟供应商的库存情况和需求变化，来确定最优的补货策略和库存水平，以应对供应链中的不确定性。通过供应链模拟和优化，系统可以帮助管理者更好地预测和应对供应链中的风险和不确定性。
最后，商业物流信息系统还应该具备供应链协同和合作功能。系统应该能够实现供应链各个环节之间的信息共享和协同工作。例如，系统可以通过与供应商和运输公司的系统对接，实现订单的实时跟踪和状态更新，以提高供应链的可见性和协同效率。通过供应链协同和合作，系统可以帮助管理者更好地协调各个环节之间的关系，减少风险和不确定性的影响。
综上所述，商业物流信息系统可以通过实时数据采集和监控、风险评估和预警、供应链模拟和优化、供应链协同和合作等方式应对供应链中的风险和不确定性。这些策略和措施可以帮助管理者更好地了解和应对供应链中的挑战，确保供应链的顺畅运作。