商业物流信息系统在保障数据安全和隐私方面有以下几点措施：
数据加密：商业物流信息系统应该采用数据加密技术，对重要的数据进行加密存储和传输，确保数据在传输和存储过程中不被窃取或篡改。
访问控制：建立严格的访问控制机制，根据员工的职责和权限设置不同的访问级别，确保只有经过授权的人员可以访问和操作系统中的数据。
安全审计：建立完善的安全审计机制，对系统中的操作和访问行为进行记录和审计，及时发现异常行为并采取相应的应对措施。
防火墙和安全设备：部署有效的防火墙和安全设备，对系统进行实时监控和防护，防止恶意攻击和病毒入侵。
数据备份和恢复：定期对系统中的重要数据进行备份，并建立有效的数据恢复机制，以防止意外数据丢失或损坏。
员工培训：加强员工的安全意识培训，教育员工正确使用系统和对数据的保护，防止内部人员的数据泄露和滥用。
除了以上措施，商业物流信息系统还可以引入区块链技术来增强数据安全性和隐私保护，通过区块链的去中心化和不可篡改特性，确保数据的真实性和完整性。同时，建立合理的数据共享和访问机制，只在必要的情况下共享数据，并对共享数据进行严格的权限控制，以降低数据泄露的风险。
案例分析：例如，某物流公司在实施物流信息系统时，采用了先进的数据加密技术和严格的访问控制机制，同时建立了定期备份和恢复机制。一次，系统遭受了黑客攻击，但由于系统的安全防护措施和及时的数据备份，成功避免了数据泄露和系统瘫痪的风险。